Consanguinité et conséquences génétiques

Rappel du premier message :

Salut à tous, j'ai il y a quelques temps j'avais fait un petit texte sur la consanguinité après une prise bec, et je me rends compte que je ne l'avais jamais posté ici... comme hier on m'a ressorti que la consanguinité n'existait pas chez les reptiles, voilà :

Un petit avertissement toutefois, ce calcul n'est valable QUE pour la reproduction SEXUEE, c'est-à-dire que la descendance est issue de la division puis de la fusion des génomes des parents.

Introduction
- Dans les calculs suivants, on nomme "q" la prévalence d'un allèle d'un gène, et "p" son contraire. C'est à dire que si q=0,5, 50% de la population peut présenter cet allèle. Un allèle est une version d'un gène, comme "avoir les yeux verts" est l'allèle pour le gène "couleur des yeux".
- Dans une population donnée, le nombre d'homozygotes pour cet allèle est de q², le nombre d'homzygotes "inverse" est de p², et le nombre d'hétérozygotes de 2pq
- La consanguinité, appelée F, et exprimée aussi sur 1, représente le %age de gène en commun entre les deux individus qui se reproduisent. Par exemple, si un individu se reproduit avec son clone, F=1. Avec son demi-frère ou sa demi-soeur, F=0,25. Avec son père ou sa mère, F=0,5. Avec un cousin germain, F= 0,0625.

Fond du problème
Le fond du problème, c'est que dans une population constante et infinie, on a p²+2pq+q²=1, si les reproductions se font au hasard.
En cas de consanguinité, les reproductions ne se font PLUS au hasard des gènes (par définition), et les hétérozygotes vont diminuer d'un facteur 1-F, et aux q² homozygotes vont s'ajouter les Fpq nouveaux homozygotes.

Par exemple, pour une tare génétique récessive portée par un animal sur 1.000, donc dont la prévalence est de 0,001.

Dans une population sans consanguinité particulière : il y
q²= 0,000001, c'est-à-dire 1 animal sur 1 sur 1.000.0000

Dans une population où on accouple un demi-frère avec une demi-soeur :
la nouvelle prévalence est de :
q²+pqF= 0,000001 + 0.00024975=0,00025075

Le nombre d'animaux présentant cette tare est multiplié par 250,75........................................
C'est à dire 1 animal sur 3988 environ.


Après, plus la tare est rare, plus la consanguinité augmente vite la prévalence. Plus elle est fréquente, moins ça augmente vite.

Pour la même prévalence, si on croise Parent-enfant : la multiplication est par 500 ; entre cousin germain simple, par 125.

Par un seul simple croisement demi frère-soeur, vous venez d'augmenter d'un facteur 250 le nombre d'animaux atteints d'une tare génétique récessive.

Il faudra introduire 250 (EDIT : coquille : ) 8 fois des animaux n'ayant aucune tare (donc pas de porteur hétérozygote, avec certitude), pour effacer les effets de votre reproduction. Or pour que cela n'arrive pas il faut tester tout le monde, sinon vous avez une chance sur 1000 de devoir tout reprendre à zéro.


Remarques
On parle d'une population infinie et dont les reproductions se font au hasard. Si la population est restreinte, la consanguinité est automatiquement bien plus forte, même avec des croisements au hasard. D'autre part, comme il n'y a pas qu'une seule personne qui fait de la consanguinité dans ce bas-monde...c'est bien pire.
Cette démonstration ne tient pas compte d'un certain nombre de choses, en particulier, on parle d'une population "sans consanguinité" au départ, ce qui n'est pas du tout le cas....on ne parle pas des "gènes liés", dont je ne connais pas forcément d'exemple en terrario, mais qui concerne les gènes présents à une distance proche sur le même chromosome. Par exemple, chez les chats Manx, le gène "sans queue" est lié à un gène léthal qui fait que les homozygotes ne se forment même pas ou peu dans le ventre de la mère....
Il est bien évident que je reste à disposition par MP ou autre pour expliquer ou détailler ce sur quoi je n'aurais pas été clair....

Gwalchafed a écrit:

Pour moi cela reste un trop gros risque pour l'espèce.

J'arrive à la même conclusion... Les "bénéfices" qu'on pourrait avoir ne valent pas le risque et le gâchis (car que fait-on des porteurs de tares visibles à chaque génération ?) engendrés...
A+
Fenchurch

Le débat est super intéressant, j'adore.

Dans vos formules mathématiques, vous avez parfois oublier quelques facteurs, je vais me permettre d'en énumérer quelques uns.

- Appât du gain
- Rentabilité
- Rapidité des profits

et j'en passe ...

Il est bon de savoir les limites qu'il ne faut pas dépasser. Malheureusement, je suis persuadé que les apprentis sorciers, qui jouent avec la génétique actuellement, n'en ont rien à faire.

Tout à fait d'accord Pat....tout ça aggrave le fait que déjà en leur absence un croisement consanguin est tout sauf anodin. Saloperie d'humains

J'ai retrouvé le lien : http://www.studbooks.org/

Allez-y faire un tour...

J'adhère à 100 % !!!

Du nouveau dans la recherche scientifique, les lézards parthénogénétiques ne sont pas aussi eugéniques que ce que l'on croyait :

Citation :

No Sex Needed: All-Female Lizard Species Cross Their Chromosomes To Make Babies - These Southwestern Lizards' Asexual Reproduction Is No Longer A Secret
By Katherine Harmon , 2/21/10 Scientific American Newsletter

Since the 1960s scientists have known that some species of whiptail lizards need a male even less than a fish needs a bicycle. These all-lady lizard species (of the Aspidoscelis genus) from Mexico and the U.S. Southwest manage to produce well-bred offspring without the aid of male fertilization.

But how do they—and the other 70 species of vertebrates that propagate this way—do it without the genetic monotony and disease vulnerability that often results from asexual reproduction? "It has remained unclear" and "has been the topic of much speculation," report a team of researchers who aimed to answer just that question. Their results were published online February 21 in the journal Nature. (Scientific American is part of Nature Publishing Group.)

These lizards and other "parthenogenetic species are genetically isolated," explains Peter Baumann, an associate investigator at the Stowers Institute for Medical Research in Kansas City, Mo., and co-author of the study. Species as diverse as Komodo dragons and hammerhead sharks do it asexually if necessary, but some species, like these little lizards, don't have a choice. "They can't exchange genetic material, and this loss of genetic exchange is a major disadvantage to them in a changing environment," he says. Unless an animal can recombine the DNA they already have, they will produce an offspring with an identical set of chromosomes, in which any genetic weakness, such as disease susceptibility or physical mutation, would have no chance to be overridden by outside genetic material from a mate.

The new research by Baumann and his team reveal that these lizards maintain genetic richness by starting the reproductive process with twice the number of chromosomes as their sexually reproducing cousins. These celibate species resulted from the hybridization of different sexual species, a process that instills the parthenogenetic lizards with a great amount of genetic diversity at the outset. And the researchers found that these species could maintain the diversity by never pairing their homologous chromosomes (as sexual species do by taking one set of chromosomes from each parent) but rather by combining their sister chromosomes instead. "Recombination between pairs of sister chromosomes maintains heterozygosity" throughout the chromosome, noted the authors of the study, which was led by Aracely Lutes, a postdoctoral researcher in Baumann's lab.

This discovery, which had until now been unconfirmed in the reptile world, means that "these lizards have a way of distinguishing sister from homologous chromosomes," Baumann says. How do they do it? That's something the group is now investigating.

Another big unknown is precisely how the lizards end up with double the amount of chromosomes in the first place. Baumann suspects that it could happen over two rounds of replication or if two sex cells combine forces before the division process starts.

Although asexual reproduction might seem like a bore—and one that can have questionable genetic outcomes unless done right—it has its benefits, too, Baumann notes. "You're greatly increasing the chances of populating a new habitat if it only takes one individual," he says, citing the example of the brahminy blind snake (Ramphotyphlops braminus), another parthenogenetic species. "If she has a way of reproducing without the help of a male, that's an extreme advantage." Indeed it is—the brahminy has already colonized six continents.

Bref, de la parthénogénèse sans reproduction à l'identique, pour éviter les inconvénients de la "consanguinité forcée"

mon anglais laissant a désiré (oui moi non plus je ne sais qui est Désiré mais a priori on dis comme ça! je sors ) une traduction existerais t-elle?

> bonjour
> suite a votre annonce j aimerais savoir si il vous
> restait des petits a vendre... j aimerais un male
> et une femmelle ... ayant deja une tite femelle a
> la maison... XX euros pour les deux? je suis dispo
> a toute heure .. je suis d etampes( 91 ) ...
> merci d avance pour votre reponse.
>
> Coordonnées du contact :
> Nom : xxxxx
> Email : xxxxxxx@hotmail.fr
> Tel : 06xxxxxxxx

voila je pense que pour évité la consanguinité il faut commencer par expliquer le problème à se genre de personne.

ce qui vaut le coup à mon avis quand on a une repro c'est de faire un échange de jeunes avec un autre éleveur afin de proposer des jeunes couples non consanguins...

cabri a écrit:

ce qui vaut le coup à mon avis quand on a une repro c'est de faire un échange de jeunes avec un autre éleveur afin de proposer des jeunes couples non consanguins...

Tout à fait d'accord avec ça.
Je me demandais justement, quand j'ai pris plusieurs espèces hyper rares chez Jon Boone, si ses jeunes n'étaient pas issus des mêmes couples. En fait, il m'a expliqué sa démarche, qui m'a laissé admiratif.

Il prend x couples WC, qu'il garde pour lui. Il ne vend jamais de WC, et récupère du CB quand il peut, mais c'est un habitué des "premières" en termes d'espèces, et lui a les contacts pour importer voire comme il le fait souvent aller dans le pays, étudier une espèce sur le terrain à fond avant de penser à l'importer, pour comprendre comment elle fonctionne. Ensuite, il ne sort que des groupes d'au moins 4-5 couples de chaque espèce. Jamais il ne propose à la vente des petits issus d'un seul couple d'une même espèce, ou alors il attend de choper plus d'adultes pour assurer des lignées bien distinctes derrière.

Ensuite, quand il a commencé à bien vendre une espèce, il "laisse la main" à ses clients et part sur d'autres espèces. Ainsi, tout le monde s'y retrouve: lui, parce qu'il fait payer, fort justement je trouve, le fait d'être souvent allé dans des endroits bien craignos pour revenir avec UNE espèce, pour l'avoir étudiée et pour avoir balayé le terrain pour les autres en termes d'infos sur la repro et le maintien en captivité. Les bêtes, parce qu'en aucun cas avec son système il n'y a de consanguinité ou alors il faut le faire exprès, étant donné que quand j'ai pris l'espèce x ou y il m'a fourni des listes d'autres mecs qui en avaient et avec qui je peux donc rentrer en contact. Ses acheteurs, parce qu'une fois qu'il laisse la main, on peut bosser sur ce qu'il nous a vendus, expérimenter nous aussi pour optimiser le maintien en captivité et revendre un bon prix en sachant de façon claire et précise qu'on ne va pas mélanger l'oncle et la soeur du beau-frère de Roger le gecko.

Lui, ça lui permet aussi de "tourner" pendant 4 à 8 ans sur une espèce, puis d'aller voir autre chose. Il en a en permanence 250 (espèces, pas geckos...c'est tout simplement le plus gros éleveur de geckonidés au monde en termes d'effectifs) qui "tournent" de cette façon...c'est aussi comme ça qu'on élargit les connaissances terrario, en allant chercher l'introuvable, le truc que personne n'a, et de se dire "bon, voyons voir comment je peux faire avec cette espèce et comment je fais pour la repro".

C'est un "luxe" tout ça, parce qu'il s'agit souvent de bêtes très chères, mais par contre on a la certitude de proposer de la Roll's à la sortie, sans forcément adopter ses tarifs à lui. Après, avec 10 parents d'une espèce rare et encore importable, les choses sont infiniment plus saines et plus claires qu'avec 2 millions de rhacos phasés et recroisés dans tous les sens ou 10 millions de gutts affaiblies génération après génération par la fièvre spéculative des Frankenstein de la sélection génétique...j'ai pas vu un seul phasé dans les listings de Jon. Ce mec n'est pas parfait, il a sûrement des travers, mais sur ce que j'ai vu, s'il a essayé de me baiser, je peux vous affirmer que j'ai rien senti...

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